PCR实验室通常采用非单向流送风方式，所谓非单向流，指气流流线方向不平行，风速也不一致。PCR实验室一般采用上送下回式。上部送风依靠送风口进入房间，下部回风依靠每个房间的对称分布的排风柱下部的排风口排风。
新风从室外进入处理机组，经过粗效、中效、亚、表冷(热)段、喷淋段(加湿)几个处理过程，然后进入洁净室
新冠核酸检测的实验室建设符合二级生物安全实验室的要求。所在区域相对独立封闭；室内布局分区明确，流程合理，严格按照清洁区、缓冲区、污染区进入实验室；靠近实验室出口处设有手卫生装置， 实验室采用独立的机械通风系统，气流流向设置合理，工作区配置有洗眼装置，实验室配备高压蒸汽灭菌器。
实验区内配备二级生物安全柜，其通风系立于其他公共的管道。
二、核酸检测实验室防控方案
3.1.3排风系统
各区域排风经过排风机组内部三级过滤（初、中、亚过滤器）后排至屋顶；排风系统设计时已考虑室内排风与生物安全柜排风进行互锁控制，保证实验室的负压不变。
3.2 负压设计（平战结合）
PCR实验室设计成负压，能够让整个PCR实验过程中试剂和样本免受污染，减少对工作人员和环境的污染。具体气体流向为：公共走廊——PCR走廊——各实验区域缓冲间——实验区域。新冠疫情期间，气流按照单向负压压力级别，降低试剂样本污染环境。疫情过后，PCR实验室通过排风量调节使这实验区域达到正压，不但满足疫情期间临时性使用要求，也能满足正常时期PCR实验室需求，达到平战转换使用原则。
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